赛菲罗斯的事件已经过去2年了，人类从巨大陨石的灾难之下逃脱。曾经繁荣的都市虽然满目疮痍，但人们已经开始投入重建家园的工作之中。而拯救世界的英雄克劳德，却过着与世隔绝的生活。但是，神秘的疾病“星痕症候群”在世界蔓延。蒂法•洛克哈特决定找寻克劳德。但当她找到克劳德之时，眼前这个人，只是一个为艾利斯之死郁郁寡欢的落魄男子。以继承赛菲罗斯的遗志而组成的白发三人组出现在人们眼前，文森特不得不再次挥动双枪，保护大家。而世界的英雄，克劳德，能否再次振作，守护这个世界呢？©豆瓣

即使死神与灭却师历经千年的血战尽头，毁灭的未来已隐约可见──王族特务·零番队迎击企图侵入灵王宫的友哈巴赫。然而，灭却师之王及其亲卫队击溃了零番队壮烈的卍解，最终踏入灵王大内里。从兵主部一兵卫手中接过守护灵王重任的黑崎一护等人，却因友哈巴赫的诡计，使一护挥剑斩向了灵王。灵王之死──意味着三界的崩溃。各界出现"扭曲"，毁灭的预兆开始笼罩世界。护廷十三队与残存的灭却师联手，向灵王宫进发。但灵王宫已落入"看不见的帝国"之手，化身为"真世界城"。亲卫队在那座仿佛嘲笑着死神们、耸立于天空的城中严阵以待。护廷十三队与亲卫队在"真世界城&q

随着友哈巴赫攻入灵王宫，死神与灭却师展开了最终决战。灵王陨落，现实世界随之崩塌。昔日的宿敌联手突入已发生异变的宫殿，共同迎战威胁万物存续的危机。